《莱莎的炼金工房 ～常暗女王与秘密藏身处～》是一部以RPG游戏《莱莎的炼金工房》为原作改编的动画作品，讲述了年轻的少女莱莎在生活无趣的边境小村庄中，不服平凡命运，向往着冒险的憧憬，遇见了能使用炼金术的神秘男子，开始了一场极富危险性和挑战性的奇妙旅程的故事。故事的主角是平凡无奇的边境小村庄青年莱莎。居住在被湖泊包围的小村庄中，日复一日的耕田捕鱼让她感到无聊和缺乏活力，于是她与幼时玩伴们重逢后，开始了一场惊心动魄的旅程。莱莎在探险过程当中，与多位不同性格的角色结伴同行，在经验和冒险的积累中，成长为一位优秀的炼金术士。此外，故事还新加入了多线剧情，为原作游戏的剧情做了更具深度的添砖加瓦。